Metod upptäcker nya varianter av covid-19
Metoden presenteras i en nyligen publicerad vetenskaplig artikel av Tiba Al-Dujaili, forskare vid institutionen för biomedicinsk vetenskap vid Malmö universitet.
Forskare på Malmö universitet har utvecklat en metod som kan upptäcka olika typer av coronavirus med hög precision. Metoden innebär att man i framtiden kommer kunna hålla jämna steg med snabbt föränderliga virus som covid-19 och andra nyuppkomna varianter.
Forskarna har konstruerat små sensorer av korta proteinbitar som kan detektera coronavirus med stor noggrannhet. Sensorerna är baserade på delar av den mänskliga ACE2-receptorn: det protein som viruset använder för att tränga in i våra celler.
Metoden presenteras i en nyligen publicerad vetenskaplig artikel av Tiba Al-Dujaili, forskare vid institutionen för biomedicinsk vetenskap vid Malmö universitet.
– Covidviruset tar sig in i våra lungor när vi andas in det och i våra lungcellerna finns det något som kallas ACE2-receptor som finns nästan överallt i kroppen. Covidviruset har en liten utskjutande del, som ser ut som en krona, och det är den som fäster på receptorn så att viruset hittar in. Det är som nyckeln till ett lås. Men genom att binda små bitar av ACE2-receptorn på viruset redan innan det når lungan, blockeras denna krona. Och det är det vår metod gör, säger Tiba Al-Dujaili.
Använder plattform som imiterar cellen
Tiba Al-Dujali ingår i professor Börje Sellergrens forskarlag, som tagit fram plattformen rSAMs (reversible Self-Assembled Monolayers) som möjliggjort denna metod.
– Man kan säga att plattformen imiterar vad som händer på och inuti cellen. Det som gör den unik är att den är reversibel. Så om man i framtiden använder tekniken för att göra ett test på en patient, kommer testet att kunna återanvändas eftersom våra kemikalier kan användas om och om igen.
Tiba Al-Dujaili, och hennes forskarkolleger tog ACE2-receptorn och skar upp den i korta bitar där de visste att viruset fäster. Sedan testade de tre olika delar av ACE2 och fäste dem antingen en i taget eller i par på ett guldchip på plattformen rSAMs.
Covid är ett mycket smart virus som ständigt förändras för att anpassa sig till nya miljöer. Med denna teknik kan vi hela tiden anpassa oss till dess senaste drag.
Tiba Al-Dujaili, forskare på Malmö universitet
När de mätte hur väl dessa ACE2-bitar binder till olika virusvarianter fann de bland annat att en enda bit av ACE2 kunde binda sig starkt till vissa varianter av viruset. Och att när man kombinerade två ACE2-bitar band den sig starkt till covidviruset SARS (som hade ett kort utbrott 2003). Men även att receptorn knappt reagerade alls på en annan typ av coronavirus som orsakar vanlig förkylning.
– Det visar att receptorn är väldigt selektiv, att den inte bryr sig om att fånga upp allt, eftersom det skulle vara meningslöst och bortkastad energi för den, säger hon.
Förutom att snabbt upptäcka framtida varianter av covid-19, kommer metoden även att kunna användas för att hitta bakterier i munnen (hos tandläkaren) eller för att upptäcka cancer i ett tidigt skede.
– Covid är ett mycket smart virus som ständigt förändras för att anpassa sig till nya miljöer och omständigheter. Med denna teknik kan vi hela tiden vara den på spåren och anpassa oss till dess senaste drag, säger forskaren Tiba Al-Dujaili.
